3 Temmuz 1992 tarih ve 3837 sayılı kanunla Ağrı Eğitim Yüksekokulu Ağrı Eğitim Fakültesine dönüştürülmüş ve Atatürk Üniversitesi Rektörlüğüne bağlı olarak 2007 yılına kadar ilköğretime yönelik lisans düzeyinde öğretim vermeye devam etmiştir.
Sağlık Yüksekokulu 2.11.1996 tarihli Resmi Gazete’ de yayınlanan 10.10.1996 tarih ve 8655 sayılı Bakanlar Kurulu Kararıyla ve Sağlık Bakanlığı ile YÖK arasında imzalanan 22.11.1996 tarihli işbirliği protokolüyle kurulmuştur. Atatürk Üniversitesi Rektörlüğüne bağlı olarak 2003-2004 öğretim yılında da ilk öğrencilerini alarak eğitim-öğretime başlamıştır.
17.05.2007 tarih ve 5662 sayılı kanunun Ek-73. maddesi ile Ağrı Dağı Üniversitesi olarak kurulan Üniversitemizin ismi 5773 sayılı kanunla Ağrı İbrahim Çeçen Üniversitesi olarak değiştirilmiş ve 28.06.2008 tarih ve 26920 sayılı Resmi Gazetede yayımlanarak yürürlüğe girmiştir.
Fakülteler
- Eğitim Fakültesi
- Fen Edebiyat Fakültesi
- İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi
- Eczacılık Fakültesi
- Tıp Fakültesi
- İslami İlimler Fakültesi
- Patnos Sultan Alparslan Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi:
- Doğubayazıt İnsan ve Toplum Bilimleri Fakültesi
- Spor Bilimleri Fakültesi
Enstitü
- Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
Yüksekokullar
- Sağlık Yüksekokulu
- Celal Oruç Hayvansal Üretim Yüksekokulu
- Turizm İşletmeciliği ve Otelcilik Yüksekokulu
- Yabancı Diller Yüksekokulu
- Patnos Sosyal Hizmetler Yüksekokulu
Meslek Yüksekokulları
- Meslek Yüksekokulu
- Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu
- Doğubayazıt Ahmed-i Hani Meslek Yüksekokulu
- Patnos Meslek Yüksekokulu
- Eleşkirt Meslek Yüksekokulu
- Sivil Havacılık Meslek Yüksekokulu
