Mıknatısın çektiği demir gibi maddeler ile karışmış başka maddeleri birbirinden ayırmak için bu yöntem kullanılır. İçinde mıknatısın çekebileceği maddelerin bulunduğu karışımları ayırmak için mıknatısla ayırma yöntemini kullanırız. Bu yöntemde kullandığımız araç mıknatıstır.
Örnek: Mesela çöpler içerisinden mıknatıs yardımıyla karışmış olan demir ayrıştırılır. Aynı zamanda demir tozu ile karışmış olan şeker bu yöntem aracılığı ile birbirinden ayrılır. Örneğin demir tozu-kum karışımında, karışımdaki demir tozunu ve kumu ayırmak için karışıma mıknatıs yaklaştırırız. Mıknatısın, karışımdaki demir tozlarını çektiğini ve geriye sadece kumun kaldığını gözlemleriz.
Mıknatıs demir (Fe), nikel (Ni), kobalt (Co) metallerine manyetik etki uygular. Yapısında bu metallerden birini barındıran karışımları ayırmak için mıknatıs kullanılır. Örneğin demir tozu – sofra tuzu karışımı, nikel tozu – tebeşir tozu karışımları bu yöntemle ayrılır.